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重要外來入侵昆蟲刺槐葉癭蚊基因組研究取得新進(jìn)展

媒體:中國林科院  作者:內(nèi)詳
專業(yè)號(hào):馬關(guān)縣林草局 2025/1/15 11:22:46

重要外來入侵昆蟲刺槐葉癭蚊基因組研究取得新進(jìn)展

2025-01-13   來源:中國林科院

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生物入侵是當(dāng)今全球面臨的主要生態(tài)問題之一,對(duì)生態(tài)環(huán)境、社會(huì)經(jīng)濟(jì)和人類健康產(chǎn)生了重大影響,迫切需要加強(qiáng)外來入侵種相關(guān)領(lǐng)域的深入研究,為外來入侵種長效防控提供科學(xué)依據(jù)。重要外來入侵昆蟲刺槐葉癭蚊(Obolodiplosis robiniae)原產(chǎn)北美東部地區(qū),近20年來,迅速在歐洲和亞洲擴(kuò)散蔓延,嚴(yán)重危害刺槐屬植物,給當(dāng)?shù)亓謽I(yè)生產(chǎn)和景觀生態(tài)造成損失,同時(shí)也嚴(yán)重破壞我國園林綠化成果。從分子水平研究入侵種的遺傳、進(jìn)化及入侵性相關(guān)特征,探討入侵種內(nèi)在適應(yīng)性機(jī)制,是了解掌握外來種成功入侵的重要環(huán)節(jié)。

本研究運(yùn)用Illumina、PacBio HiFi和Hi-C技術(shù),在染色體水平上組裝了刺槐葉癭蚊高質(zhì)量基因組。組裝的基因組大小為199.49Mb,contig N50為4.66Mb。經(jīng)過Hi-C搭建,contigs被組裝到4條染色體上,比對(duì)率大于98%。scaffold N50長度為47.6Mb,通用單拷貝同源基因基準(zhǔn)(Benchmarking Universal Single-Copy Orthologues,BUSCO)值為90.3%。通過注釋,發(fā)現(xiàn)基因組包含15055個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因。該研究結(jié)果將為下一步開展刺槐葉癭蚊進(jìn)化、入侵性特征以及與專性天敵互作關(guān)系研究提供理論依據(jù),進(jìn)而為實(shí)施有效的檢疫管理與防控策略奠定基礎(chǔ)。

研究結(jié)果以“The chromosome-level genome assembly and annotation of an invasive forest pestObolodiplosis robiniae”為題,于2024年11月發(fā)表在《Scientific Data》(JCR 1區(qū),IF=5.8)。中國林科院森環(huán)森保所植物檢疫與外來有害生物學(xué)科組已畢業(yè)碩士研究生黃嵐為論文第一作者,姚艷霞研究員和北京市農(nóng)林科學(xué)院魏書軍研究員為論文共同通訊作者。該研究得到了國家自然科學(xué)基金和中國林業(yè)科學(xué)研究院基本科研業(yè)務(wù)費(fèi)專項(xiàng)項(xiàng)目的共同資助。(黃嵐 林若竹)

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